Néanmoins, l’estuaire est toujours un secteur unique pour l’ensemble des espèces de poissons amphihalins qui le fréquente. Les fonds marins vaseux sont des zones essentielles pour l’esturgeon européen. Cette zone abrite également des ressources halieutiques très localisées comme la crevette blanche, la lamproie ou le maigre qui vient s’y reproduire. Les oiseaux d’eau côtiers trouvent dans les vastes vasières toute l’alimentation nécessaire à proximité de leur nid.

Les pêcheurs professionnels, de moins en moins nombreux, utilisent des techniques particulières : pêche à l’écoute pour le maigre et usage d’engins particuliers pour la pêche aux crevettes blanches ou à la civelle (les pibalous).

Autre particularité, le paysage de l’estuaire est fortement marqué par la présence de nombreux carrelets, ces petites cabanes sur pilotis destinées à la pêche récréative !